Dans La "Haute-Saône culinaire", il est relaté une légende disant que la cancoillotte est apparue il y a plus de deux mille ans alors que la région Franche-Comté s’appelait encore la Séquanie. La cancoillotte est avant tout une spécialité fromagère du Pays comtois, en particulier du bas pays (la Haute-Saône et les vallées) où le lait était abondant.
L'entreprise de Loulans-Verchamp la fabrique encore et approvisionne la Cancoillotte des marques "Président", "la Belle Etoile"ou "Raguin"...